במהלך ה- reprogramming תהליך התכנות מחדש, תאים עוברים שינויים דינמיים והדרגתיים, כאשר תאים שעברו תכנות מחדש יציגו ביטוי של דפוסי גנים של תאי ES, ותאים מתוכנתים חלקית יציגו פנוטיפ ביניים. לפיכך, סמנים קלאסיים למצב עוברי פלוריפוטנטי, כגון פעילות פוספטאז אלקליין או TRA1-60- ו- 81 וביטוי SSEA1-4, הם קריטיים למעקב אחר תכנות מחדש של תאים. סמנים אלה, יחד עם אחרים, באים לידי ביטוי בזמנים שונים לאורך תהליך התכנות מחדש ומחקרים הבודקים שינויים בחלבונים אלה מהווים כיום נושא אטרקטיבי במחקר תאי iPS. נציע לכם במרקורי תאי IPS או פיברוסלסטים שעברו או לא עברו אינאקטיבציה, מעכבר או מאדם.